HCE/HOW-TO の変更点

• 追加された行はこの色です。
• 削除された行はこの色です。
• HCE/HOW-TO へ行く。
• HCE/HOW-TO の差分を削除

[[HCE]]

*HCE HOW-TO [#aa185be1]
-[[HCE 3.0 Manual:http://www.cs.umd.edu/hcil/hce/hce3-manual/hce3_manual.html]]

-Tips
--5.3 Specify whether users want to do a clustering on rows and/or columns (samples or experimental conditions)~
If users uncheck "Cluster Rows", the data items (, or rows) will not be clustered, but they will be sorted by the average values of items.  If users uncheck "Cluster Columns", the original order of columns in the input file will be preserved (neither clustering nor sorting will be done). So, if the input dataset is a time-series data set that the order of columns in the input is important, it is better to uncheck it because columns clustering may change the order of columns.~
時系列データを扱うときはチェックを外す（時間的順序が大事なデータだから）．

--5.6 Choose a distance/similarity measure~
距離／類似度は，ピアソン相関係数，ユークリッド距離，[[マンハッタン距離:http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%9E%E3%83%B3%E3%83%8F%E3%83%83%E3%82%BF%E3%83%B3%E8%B7%9D%E9%9B%A2]]~
If users want to try a different combination of clustering parameters (linkage method, distance measure, and/or node arrangement method) without reloading the data set, click the clustering icon on the main tool bar, and select a different combination on the dialog box.~
クラスタリングの計算方法を変更させたい時は，ツールボックスからCのアイコンをクリック．~
Note: The check box "Use P-Values as Weights" is for Affymetrix GeneChip experiment data. Please refer to the signal/noise analysis page for more detail.


--その他
---HCEに読み込むファイル形式を.xls形式で読み込むとなぜかセルの値に小数点がついてしまう．
---CSV形式に変換したファイルを入力として読み込むとセルの値がそのまま読み込まれる．
---どうやらセル中に含まれる値の小数点の桁数があまりにも多いとグラフの描写中にHCEが落ちてしまう．